Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5dQ62240 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5dQ62240 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5dQ62240 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5dQ62240 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5dQ62240 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5dQ62240 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5dQ62240 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms