Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cln3Q61124 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cln3Q61124 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cln3Q61124 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cln3Q61124 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms