Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms