Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim58Q5NCC9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms