Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rtl6Q505G4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rtl6Q505G4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rtl6Q505G4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtl6Q505G4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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