Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms