Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp19Q3UJD6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp19Q3UJD6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp19Q3UJD6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp19Q3UJD6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp19Q3UJD6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Usp19Q3UJD6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Usp19Q3UJD6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp19Q3UJD6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp19Q3UJD6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp19Q3UJD6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms