Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b2Q3UJB0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms