Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf180Q3U827 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rnf180Q3U827 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf180Q3U827 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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