Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Kdm4dQ3U2K5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Kdm4dQ3U2K5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Kdm4dQ3U2K5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kdm4dQ3U2K5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kdm4dQ3U2K5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kdm4dQ3U2K5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kdm4dQ3U2K5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kdm4dQ3U2K5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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