Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms