Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms