Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hddc2Q3SXD3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms