Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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