Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samd12Q0VE29 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms