Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms