Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MitfQ08874 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms