Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox10Q04888 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms