Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms