Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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