Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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