Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme1P97371 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psme1P97371 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms