Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RhodP97348 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RhodP97348 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RhodP97348 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms