Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Irx1P81068 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Irx1P81068 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Irx1P81068 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Irx1P81068 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Irx1P81068 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Irx1P81068 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Irx1P81068 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Irx1P81068 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Irx1P81068 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Irx1P81068 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Irx1P81068 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Irx1P81068 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Irx1P81068 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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