Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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