Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Setd4P58467 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms