Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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