Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms