Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RorcP51450 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RorcP51450 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RorcP51450 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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