Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NodalP43021 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NodalP43021 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NodalP43021 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NodalP43021 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NodalP43021 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NodalP43021 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NodalP43021 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms