Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms