Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbP41155 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbP41155 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms