Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Apoc1P34928 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms