Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms