Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb1P28230 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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