Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NdnP25233 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NdnP25233 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NdnP25233 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NdnP25233 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms