Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RarbP22605 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RarbP22605 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RarbP22605 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RarbP22605 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms