Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18530 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms