Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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