Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fv4P11370 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms