Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms