Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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