Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vamp4O70480 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vamp4O70480 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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