Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms