Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms