Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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