Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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