Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Efna3O08545 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms