Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms