Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm21818J3KMS6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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